Учредителем  ГБНОУ «Спортивный интернат «Чертаново» (Академии «Чертаново») является город Москва. Функции и полномочия учредителя Учреждения осуществляет Департамент спорта города Москвы (Москомспорт).

Департамент спорта города Москвы, которым руководит Алексей Александрович Кондаранцев, является отраслевым органом исполнительной власти города Москвы, осуществляющим функции по разработке и реализации государственной политики, предоставлению государственных услуг в области физической культуры, спорта.

Департамент предоставляет государственные услуги в области физической культуры и спорта отвечает за развитие массовой физической культуры и спорта высших достижений, организацию и проведение физкультурных и спортивных мероприятий, развитие и координацию международных и межрегиональных связей в этих сферах.
Академия финансируется из бюджета города Москвы. Депаратмент осуществляет общее руководство её деятельностью.

«Чертаново» является опорной футбольной школой Москомспорта. Воспитанники Академии представляют Москву на Всероссийских соревнованиях, включая Спартакиады и Первенства России по футболу. Большинство юношеских и женских сборных Москвы по футболу сформированы на базе команд «Чертаново».